Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frem2Q6NVD0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms