Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg16l2Q6KAU8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg16l2Q6KAU8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg16l2Q6KAU8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms