Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms