Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms