Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc8eQ66JT1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms