Protein–RNA interactions for Protein: Q64729

Tgfbr1, TGF-beta receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr1Q64729 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr1Q64729 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfbr1Q64729 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms