Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms