Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nptx1Q62443 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms