Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Odf1Q61999 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Odf1Q61999 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Odf1Q61999 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Odf1Q61999 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Odf1Q61999 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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