Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms