Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik1Q60934 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms