Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2dQ60773 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms