Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm1Q60636 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm1Q60636 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm1Q60636 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm1Q60636 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm1Q60636 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm1Q60636 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm1Q60636 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm1Q60636 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms