Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms