Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ttf2Q5NC05 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms