Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBH1

Rassf5, Ras association domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf5Q5EBH1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rassf5Q5EBH1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rassf5Q5EBH1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rassf5Q5EBH1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rassf5Q5EBH1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rassf5Q5EBH1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rassf5Q5EBH1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rassf5Q5EBH1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rassf5Q5EBH1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rassf5Q5EBH1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rassf5Q5EBH1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rassf5Q5EBH1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rassf5Q5EBH1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rassf5Q5EBH1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rassf5Q5EBH1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rassf5Q5EBH1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rassf5Q5EBH1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf5Q5EBH1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms