Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5EBG8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5EBG8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5EBG8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q5EBG8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms