Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam208bQ5DTT3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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