Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnl1Q52KE7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms