Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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