Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn4Q3UV66 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms