Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms