Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Prrc1Q3UPH1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Prrc1Q3UPH1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Prrc1Q3UPH1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Prrc1Q3UPH1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Prrc1Q3UPH1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Prrc1Q3UPH1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Prrc1Q3UPH1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Prrc1Q3UPH1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Prrc1Q3UPH1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Prrc1Q3UPH1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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