Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms