Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW5

Rnf10, RING finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf10Q3UIW5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf10Q3UIW5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf10Q3UIW5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms