Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms