Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft2Q3UF64 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms