Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U6N9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U6N9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms