Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ssbp4Q3U4B1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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