Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ulk3Q3U3Q1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms