Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
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Hvcn1Q3U2S8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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Hvcn1Q3U2S8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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Hvcn1Q3U2S8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Hvcn1Q3U2S8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Hvcn1Q3U2S8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Hvcn1Q3U2S8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Hvcn1Q3U2S8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Hvcn1Q3U2S8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Hvcn1Q3U2S8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hvcn1Q3U2S8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms