Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc127Q3TC33 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc127Q3TC33 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms