Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms