Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Rpusd2Q149F1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Rpusd2Q149F1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Rpusd2Q149F1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Rpusd2Q149F1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Rpusd2Q149F1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Rpusd2Q149F1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Rpusd2Q149F1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Rpusd2Q149F1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Rpusd2Q149F1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Rpusd2Q149F1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Rpusd2Q149F1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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