Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtel1Q0VGM9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtel1Q0VGM9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtel1Q0VGM9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtel1Q0VGM9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtel1Q0VGM9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtel1Q0VGM9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtel1Q0VGM9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtel1Q0VGM9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtel1Q0VGM9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtel1Q0VGM9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtel1Q0VGM9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtel1Q0VGM9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtel1Q0VGM9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtel1Q0VGM9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtel1Q0VGM9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms