Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms