Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms