Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms