Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcn1Q05186 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms