Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms