Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox10Q04888 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox10Q04888 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms