Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox8Q04886 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms