Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms