Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms