Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms