Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra1P97785 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra1P97785 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra1P97785 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra1P97785 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra1P97785 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra1P97785 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra1P97785 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra1P97785 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra1P97785 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra1P97785 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra1P97785 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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