Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx2P81066 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx2P81066 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx2P81066 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx2P81066 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx2P81066 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms