Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeboxP70368 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SeboxP70368 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeboxP70368 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeboxP70368 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeboxP70368 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeboxP70368 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeboxP70368 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeboxP70368 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeboxP70368 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeboxP70368 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeboxP70368 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeboxP70368 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeboxP70368 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeboxP70368 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeboxP70368 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeboxP70368 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeboxP70368 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeboxP70368 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms