Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NficP70255 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NficP70255 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NficP70255 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NficP70255 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NficP70255 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NficP70255 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NficP70255 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NficP70255 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NficP70255 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NficP70255 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NficP70255 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NficP70255 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NficP70255 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NficP70255 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NficP70255 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NficP70255 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NficP70255 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NficP70255 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NficP70255 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NficP70255 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NficP70255 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NficP70255 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NficP70255 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NficP70255 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NficP70255 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NficP70255 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NficP70255 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NficP70255 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NficP70255 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NficP70255 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NficP70255 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NficP70255 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NficP70255 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NficP70255 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NficP70255 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NficP70255 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NficP70255 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NficP70255 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NficP70255 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NficP70255 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NficP70255 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NficP70255 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NficP70255 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NficP70255 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NficP70255 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NficP70255 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NficP70255 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NficP70255 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NficP70255 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NficP70255 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NficP70255 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NficP70255 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NficP70255 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NficP70255 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NficP70255 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NficP70255 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NficP70255 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NficP70255 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NficP70255 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NficP70255 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NficP70255 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NficP70255 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NficP70255 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NficP70255 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NficP70255 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NficP70255 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NficP70255 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NficP70255 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NficP70255 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NficP70255 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NficP70255 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NficP70255 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NficP70255 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NficP70255 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NficP70255 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NficP70255 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NficP70255 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NficP70255 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NficP70255 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NficP70255 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NficP70255 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NficP70255 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NficP70255 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NficP70255 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NficP70255 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NficP70255 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NficP70255 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NficP70255 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NficP70255 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NficP70255 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NficP70255 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NficP70255 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NficP70255 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NficP70255 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NficP70255 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NficP70255 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NficP70255 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NficP70255 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NficP70255 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms