Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb4bP68372 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms